Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KRW8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KRW8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KRW8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KRW8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KRW8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KRW8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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