Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NOP58Q9Y2X3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NOP58Q9Y2X3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NOP58Q9Y2X3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NOP58Q9Y2X3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NOP58Q9Y2X3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms