Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC3Q9Y282 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC3Q9Y282 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC3Q9Y282 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC3Q9Y282 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms