Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NECAP2Q9NVZ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECAP2Q9NVZ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms