Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTNNBIP1Q9NSA3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNBIP1Q9NSA3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTNNBIP1Q9NSA3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms