Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS4

TCF7L1, Transcription factor 7-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF7L1Q9HCS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF7L1Q9HCS4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF7L1Q9HCS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF7L1Q9HCS4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF7L1Q9HCS4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms