Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3GL1Q99961 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3GL1Q99961 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3GL1Q99961 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3GL1Q99961 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3GL1Q99961 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms