Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAS2Q99743 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPAS2Q99743 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAS2Q99743 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS2Q99743 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms