Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF18Q99633 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF18Q99633 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF18Q99633 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms