Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC6Q96SB8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC6Q96SB8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC6Q96SB8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMC6Q96SB8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMC6Q96SB8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms