Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSI2Q96DH6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI2Q96DH6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI2Q96DH6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms