Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC45Q96CN5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC45Q96CN5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC45Q96CN5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC45Q96CN5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC45Q96CN5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC45Q96CN5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms