Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDAQ92838 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDAQ92838 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDAQ92838 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDAQ92838 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDAQ92838 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDAQ92838 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDAQ92838 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDAQ92838 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDAQ92838 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDAQ92838 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDAQ92838 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDAQ92838 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDAQ92838 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDAQ92838 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDAQ92838 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDAQ92838 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDAQ92838 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDAQ92838 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDAQ92838 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EDAQ92838 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDAQ92838 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDAQ92838 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDAQ92838 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EDAQ92838 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDAQ92838 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDAQ92838 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDAQ92838 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDAQ92838 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDAQ92838 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDAQ92838 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDAQ92838 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDAQ92838 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDAQ92838 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDAQ92838 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EDAQ92838 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDAQ92838 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDAQ92838 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDAQ92838 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDAQ92838 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDAQ92838 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDAQ92838 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EDAQ92838 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDAQ92838 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDAQ92838 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDAQ92838 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDAQ92838 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDAQ92838 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDAQ92838 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDAQ92838 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDAQ92838 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EDAQ92838 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDAQ92838 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDAQ92838 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDAQ92838 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDAQ92838 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDAQ92838 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDAQ92838 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDAQ92838 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDAQ92838 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDAQ92838 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EDAQ92838 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDAQ92838 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDAQ92838 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EDAQ92838 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDAQ92838 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDAQ92838 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDAQ92838 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDAQ92838 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDAQ92838 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDAQ92838 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDAQ92838 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDAQ92838 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDAQ92838 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDAQ92838 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDAQ92838 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDAQ92838 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDAQ92838 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDAQ92838 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDAQ92838 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EDAQ92838 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDAQ92838 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDAQ92838 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDAQ92838 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDAQ92838 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDAQ92838 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDAQ92838 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDAQ92838 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
EDAQ92838 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDAQ92838 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDAQ92838 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDAQ92838 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDAQ92838 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDAQ92838 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDAQ92838 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDAQ92838 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDAQ92838 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDAQ92838 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDAQ92838 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDAQ92838 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms