Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRUB1Q8WWH5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB1Q8WWH5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB1Q8WWH5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRUB1Q8WWH5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms