Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF397Q8NF99 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF397Q8NF99 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF397Q8NF99 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF397Q8NF99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF397Q8NF99 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms