Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNX2Q8N448 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LNX2Q8N448 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX2Q8N448 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms