Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSRQ86X29 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSRQ86X29 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSRQ86X29 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSRQ86X29 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSRQ86X29 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms