Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H9

FAM220A, Protein FAM220A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220AQ7Z4H9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM220AQ7Z4H9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220AQ7Z4H9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220AQ7Z4H9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM220AQ7Z4H9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM220AQ7Z4H9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms