Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 MASP2-204ENST00000480221 2190 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 TAGLN-201ENST00000278968 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 TAGLN-208ENST00000533863 3298 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 MASP2-201ENST00000400897 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 ANKRD52-203ENST00000548241 651 ntTSL 312.13□□□□□ -0.471e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 TAGLN-203ENST00000525531 1048 ntAPPRIS P1 TSL 511.8□□□□□ -0.521e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 S100A11-202ENST00000478109 557 ntTSL 34.39□□□□□ -1.711e-9■■■■■ 35.1
LARP4Q71RC2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 518.02■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.317e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 215.71■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.077e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 RPL41-201ENST00000358888 551 ntTSL 39.07□□□□□ -0.961e-29■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.11e-29■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-29■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 RPL41-203ENST00000546485 335 ntTSL 27.15□□□□□ -1.261e-29■■■■■ 34.9
LARP4Q71RC2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 ITFG1-211ENST00000568047 2636 ntTSL 56.87□□□□□ -1.314e-7■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 ITFG1-202ENST00000537184 1422 ntTSL 26□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 ITFG1-203ENST00000542691 1464 ntTSL 24.82□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 TIMM10-203ENST00000525587 486 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 34.8
LARP4Q71RC2 RNASEK-208ENST00000570898 425 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 34.7
LARP4Q71RC2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.662e-12■■■■■ 34.7
LARP4Q71RC2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-12■■■■■ 34.7
LARP4Q71RC2 DUT-206ENST00000558978 1171 ntTSL 317.47■□□□□ 0.392e-12■■■■■ 34.7
LARP4Q71RC2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-12■■■■■ 34.7
LARP4Q71RC2 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.672e-12■■■■■ 34.6
LARP4Q71RC2 CPED1-207ENST00000466055 543 ntTSL 35.62□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 34.5
LARP4Q71RC2 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC6.85□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 34.5
LARP4Q71RC2 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 34.5
LARP4Q71RC2 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 34.5
LARP4Q71RC2 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 34.5
LARP4Q71RC2 ATP5G1-208ENST00000513781 759 ntTSL 313.1□□□□□ -0.315e-9■■■■■ 34.3
LARP4Q71RC2 ATP5G1-201ENST00000355938 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.735e-9■■■■■ 34.3
LARP4Q71RC2 ATP5G1-204ENST00000503641 539 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.755e-9■■■■■ 34.3
LARP4Q71RC2 ATP5G1-206ENST00000506855 468 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.865e-9■■■■■ 34.3
LARP4Q71RC2 ATP5G1-207ENST00000513347 2214 ntTSL 29.38□□□□□ -0.915e-9■■■■■ 34.3
LARP4Q71RC2 ATP5G1-202ENST00000393366 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.945e-9■■■■■ 34.3
LARP4Q71RC2 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.434e-6■■■■■ 34.3
LARP4Q71RC2 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.64e-6■■■■■ 34.3
LARP4Q71RC2 RARRES2-204ENST00000478771 1907 ntTSL 221.39■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 34.2
LARP4Q71RC2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 34.2
LARP4Q71RC2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 34.2
LARP4Q71RC2 RARRES2-203ENST00000467793 583 ntTSL 314.51□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 34.2
LARP4Q71RC2 FAF1-204ENST00000487898 681 ntTSL 34.87□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 34.2
LARP4Q71RC2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 ELP4-214ENST00000638917 2306 ntTSL 512.59□□□□□ -0.394e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 ELP4-221ENST00000640081 2385 ntTSL 512.36□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 ELP4-205ENST00000638184 1330 ntTSL 510.34□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 ELP4-226ENST00000640790 1249 ntTSL 59.13□□□□□ -0.954e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.295e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.271e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.769e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.679e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 RUVBL2-204ENST00000594338 1853 ntTSL 519.09■□□□□ 0.659e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 TMEM256-PLSCR3-203ENST00000571125 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.59■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 RUVBL2-208ENST00000596247 1563 ntTSL 218.47■□□□□ 0.559e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.15■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 RUVBL2-201ENST00000221413 1478 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.149e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 562 ntAPPRIS P5 TSL 315.55■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.255e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 213.44□□□□□ -0.266e-9■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 TMEM256-202ENST00000575427 403 ntTSL 211.66□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 RUVBL2-205ENST00000595002 546 ntTSL 211.28□□□□□ -0.69e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 TMEM256-203ENST00000576017 511 ntTSL 38.18□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 CTNNA3-204ENST00000494580 470 ntTSL 34.64□□□□□ -1.679e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.719e-8■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.441e-9■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 34.1
LARP4Q71RC2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 MAGI1-208ENST00000472257 3045 ntTSL 514.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 34
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 53.3 ms