Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC04

ATP1A1-AS1, Putative uncharacterized protein ATP1A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1-AS1Q5TC04 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A1-AS1Q5TC04 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A1-AS1Q5TC04 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP1A1-AS1Q5TC04 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A1-AS1Q5TC04 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms