Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRIF1Q5T3J3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIF1Q5T3J3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIF1Q5T3J3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRIF1Q5T3J3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 529.7 ms