Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 CHS7YHR142W 951 nt8.01□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 EHT1YBR177C 1356 nt8□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 TDA4YJR116W 840 nt8□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 YLR280CYLR280C 351 nt8□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 OLA1YBR025C 1185 nt8□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 DIP5YPL265W 1827 nt8□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 RNA170RNA170 169 nt7.99□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.98□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 CYC3YAL039C 810 nt7.98□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 MET22YOL064C 1074 nt7.98□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 IPL1YPL209C 1104 nt7.98□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 SRP102YKL154W 735 nt7.97□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 PAB1YER165W 1734 nt7.97□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 DTR1YBR180W 1719 nt7.97□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 PMT7YDR307W 1989 nt7.97□□□□□ -1.13
SPE4Q12455 SLM3YDL033C 1254 nt7.96□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 RCF1YML030W 480 nt7.96□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 MRP7YNL005C 1116 nt7.96□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 YBR232CYBR232C 360 nt7.96□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.95□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.95□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.95□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 WSC4YHL028W 1818 nt7.94□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 ERO1YML130C 1692 nt7.94□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 KTR4YBR199W 1395 nt7.94□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 PDC6YGR087C 1692 nt7.93□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 WSC3YOL105C 1671 nt7.93□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.93□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 ILV2YMR108W 2064 nt7.92□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 ARO3YDR035W 1113 nt7.92□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 YGR137WYGR137W 375 nt7.92□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 RHO1YPR165W 630 nt7.92□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 ALG7YBR243C 1347 nt7.92□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 OCH1YGL038C 1443 nt7.91□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 MET13YGL125W 1803 nt7.91□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 GNP1YDR508C 1992 nt7.9□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.9□□□□□ -1.14
SPE4Q12455 YCR025CYCR025C 411 nt7.89□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 THI73YLR004C 1572 nt7.88□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 LPD1YFL018C 1500 nt7.88□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 PUP3YER094C 618 nt7.88□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 YMR166CYMR166C 1107 nt7.88□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 SHC1YER096W 1539 nt7.88□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 CAK1YFL029C 1107 nt7.87□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.87□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 HXT8YJL214W 1710 nt7.86□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 SER2YGR208W 930 nt7.85□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 YPL264CYPL264C 1062 nt7.85□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 GTB1YDR221W 2109 nt7.85□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 MTC6YHR151C 1581 nt7.84□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 SNP1YIL061C 903 nt7.84□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 ELP6YMR312W 822 nt7.84□□□□□ -1.15
SPE4Q12455 YGR210CYGR210C 1236 nt7.83□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 SGF73YGL066W 1974 nt7.82□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 PMT1YDL095W 2454 nt7.82□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.82□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.82□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.82□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.82□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.82□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 RRT6YGL146C 936 nt7.82□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 LSP1YPL004C 1026 nt7.82□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 HTS1YPR033C 1641 nt7.81□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 RSC9YML127W 1746 nt7.81□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 YPT31YER031C 672 nt7.81□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 CKB1YGL019W 837 nt7.81□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 NAS6YGR232W 687 nt7.81□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 AIM34YMR003W 597 nt7.81□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 TPO1YLL028W 1761 nt7.81□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 AVL9YLR114C 2295 nt7.81□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 RRT14YIL127C 621 nt7.79□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 CDA1YLR307W 906 nt7.79□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 HXT9YJL219W 1704 nt7.78□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 TES1YJR019C 1050 nt7.78□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 YPL108WYPL108W 507 nt7.78□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 PRC1YMR297W 1599 nt7.78□□□□□ -1.16
SPE4Q12455 MET30YIL046W 1923 nt7.77□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 YER152CYER152C 1332 nt7.77□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 YJL064WYJL064W 396 nt7.76□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 SPE4YLR146C 903 nt7.76□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 PRE10YOR362C 867 nt7.76□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 FCY1YPR062W 477 nt7.76□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 PEX28YHR150W 1740 nt7.75□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 ITR1YDR497C 1755 nt7.75□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 SEN2YLR105C 1134 nt7.75□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 YNL190WYNL190W 615 nt7.75□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 PDC5YLR134W 1692 nt7.75□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 TIM50YPL063W 1431 nt7.75□□□□□ -1.17
SPE4Q12455 BEM1YBR200W 1656 nt7.74□□□□□ -1.17
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