Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RELBQ01201 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELBQ01201 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RELBQ01201 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RELBQ01201 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELBQ01201 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELBQ01201 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RELBQ01201 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RELBQ01201 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RELBQ01201 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RELBQ01201 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RELBQ01201 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RELBQ01201 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RELBQ01201 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RELBQ01201 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RELBQ01201 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RELBQ01201 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RELBQ01201 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RELBQ01201 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RELBQ01201 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RELBQ01201 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RELBQ01201 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RELBQ01201 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELBQ01201 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELBQ01201 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELBQ01201 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELBQ01201 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELBQ01201 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RELBQ01201 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELBQ01201 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RELBQ01201 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RELBQ01201 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RELBQ01201 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELBQ01201 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELBQ01201 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELBQ01201 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RELBQ01201 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RELBQ01201 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RELBQ01201 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RELBQ01201 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELBQ01201 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RELBQ01201 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RELBQ01201 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELBQ01201 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELBQ01201 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RELBQ01201 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RELBQ01201 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELBQ01201 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELBQ01201 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RELBQ01201 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RELBQ01201 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RELBQ01201 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELBQ01201 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RELBQ01201 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELBQ01201 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELBQ01201 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELBQ01201 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELBQ01201 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELBQ01201 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELBQ01201 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELBQ01201 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RELBQ01201 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RELBQ01201 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELBQ01201 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELBQ01201 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELBQ01201 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELBQ01201 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELBQ01201 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RELBQ01201 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RELBQ01201 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RELBQ01201 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RELBQ01201 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RELBQ01201 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RELBQ01201 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RELBQ01201 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RELBQ01201 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RELBQ01201 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RELBQ01201 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELBQ01201 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELBQ01201 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELBQ01201 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELBQ01201 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELBQ01201 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RELBQ01201 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RELBQ01201 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RELBQ01201 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RELBQ01201 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RELBQ01201 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RELBQ01201 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RELBQ01201 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RELBQ01201 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RELBQ01201 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RELBQ01201 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RELBQ01201 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RELBQ01201 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RELBQ01201 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RELBQ01201 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RELBQ01201 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RELBQ01201 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RELBQ01201 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms