Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2BP67870 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK2BP67870 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK2BP67870 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK2BP67870 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms