Protein–RNA interactions for Protein: P62269

RPS18, 40S ribosomal protein S18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS18P62269 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS18P62269 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS18P62269 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS18P62269 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS18P62269 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS18P62269 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS18P62269 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS18P62269 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS18P62269 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS18P62269 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS18P62269 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS18P62269 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS18P62269 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS18P62269 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS18P62269 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS18P62269 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS18P62269 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS18P62269 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS18P62269 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS18P62269 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS18P62269 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS18P62269 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS18P62269 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS18P62269 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS18P62269 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS18P62269 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS18P62269 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS18P62269 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS18P62269 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS18P62269 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS18P62269 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS18P62269 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS18P62269 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS18P62269 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS18P62269 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS18P62269 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS18P62269 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS18P62269 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS18P62269 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS18P62269 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS18P62269 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS18P62269 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS18P62269 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS18P62269 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS18P62269 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS18P62269 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS18P62269 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS18P62269 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS18P62269 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS18P62269 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS18P62269 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS18P62269 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS18P62269 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS18P62269 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS18P62269 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS18P62269 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS18P62269 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS18P62269 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS18P62269 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS18P62269 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS18P62269 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS18P62269 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS18P62269 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS18P62269 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS18P62269 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS18P62269 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS18P62269 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS18P62269 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS18P62269 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS18P62269 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS18P62269 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS18P62269 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS18P62269 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS18P62269 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS18P62269 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS18P62269 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS18P62269 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS18P62269 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS18P62269 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS18P62269 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS18P62269 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS18P62269 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS18P62269 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS18P62269 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS18P62269 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS18P62269 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS18P62269 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS18P62269 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS18P62269 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS18P62269 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS18P62269 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms