Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42P60953 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42P60953 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42P60953 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42P60953 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42P60953 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42P60953 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42P60953 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42P60953 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42P60953 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42P60953 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42P60953 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42P60953 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42P60953 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42P60953 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42P60953 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42P60953 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42P60953 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42P60953 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42P60953 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42P60953 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42P60953 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42P60953 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42P60953 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42P60953 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42P60953 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42P60953 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42P60953 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42P60953 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42P60953 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42P60953 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42P60953 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42P60953 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42P60953 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42P60953 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42P60953 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42P60953 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42P60953 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42P60953 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42P60953 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42P60953 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42P60953 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42P60953 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42P60953 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42P60953 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42P60953 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC42P60953 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42P60953 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC42P60953 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42P60953 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42P60953 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDC42P60953 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42P60953 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42P60953 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42P60953 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42P60953 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42P60953 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42P60953 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42P60953 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42P60953 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42P60953 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42P60953 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42P60953 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42P60953 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42P60953 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42P60953 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42P60953 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42P60953 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42P60953 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42P60953 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42P60953 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42P60953 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42P60953 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42P60953 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42P60953 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42P60953 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42P60953 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42P60953 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42P60953 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42P60953 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42P60953 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms