Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPT1P50897 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPT1P50897 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPT1P50897 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPT1P50897 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPT1P50897 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPT1P50897 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPT1P50897 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPT1P50897 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPT1P50897 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPT1P50897 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPT1P50897 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPT1P50897 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPT1P50897 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPT1P50897 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPT1P50897 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPT1P50897 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPT1P50897 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPT1P50897 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPT1P50897 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPT1P50897 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPT1P50897 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPT1P50897 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPT1P50897 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPT1P50897 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPT1P50897 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PPT1P50897 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPT1P50897 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPT1P50897 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPT1P50897 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPT1P50897 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPT1P50897 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPT1P50897 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPT1P50897 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPT1P50897 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPT1P50897 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PPT1P50897 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPT1P50897 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPT1P50897 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPT1P50897 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPT1P50897 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPT1P50897 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPT1P50897 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPT1P50897 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPT1P50897 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPT1P50897 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPT1P50897 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPT1P50897 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPT1P50897 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPT1P50897 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPT1P50897 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPT1P50897 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPT1P50897 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPT1P50897 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPT1P50897 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPT1P50897 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPT1P50897 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPT1P50897 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPT1P50897 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPT1P50897 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPT1P50897 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPT1P50897 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPT1P50897 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPT1P50897 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPT1P50897 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPT1P50897 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPT1P50897 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPT1P50897 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPT1P50897 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPT1P50897 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPT1P50897 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPT1P50897 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPT1P50897 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPT1P50897 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPT1P50897 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPT1P50897 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPT1P50897 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPT1P50897 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPT1P50897 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPT1P50897 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPT1P50897 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPT1P50897 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPT1P50897 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPT1P50897 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPT1P50897 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPT1P50897 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms