Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SELENOPP49908 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SELENOPP49908 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENOPP49908 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms