Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX2P48431 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX2P48431 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX2P48431 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX2P48431 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX2P48431 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX2P48431 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX2P48431 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX2P48431 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX2P48431 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX2P48431 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX2P48431 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX2P48431 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX2P48431 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX2P48431 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX2P48431 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX2P48431 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX2P48431 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX2P48431 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX2P48431 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX2P48431 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX2P48431 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX2P48431 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX2P48431 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX2P48431 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX2P48431 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX2P48431 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX2P48431 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX2P48431 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX2P48431 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX2P48431 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX2P48431 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX2P48431 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX2P48431 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX2P48431 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX2P48431 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX2P48431 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX2P48431 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX2P48431 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX2P48431 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX2P48431 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX2P48431 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX2P48431 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX2P48431 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX2P48431 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX2P48431 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX2P48431 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX2P48431 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX2P48431 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX2P48431 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX2P48431 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX2P48431 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX2P48431 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX2P48431 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX2P48431 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX2P48431 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX2P48431 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX2P48431 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX2P48431 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX2P48431 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX2P48431 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX2P48431 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX2P48431 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX2P48431 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX2P48431 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX2P48431 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX2P48431 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX2P48431 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX2P48431 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX2P48431 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX2P48431 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX2P48431 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX2P48431 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX2P48431 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX2P48431 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX2P48431 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX2P48431 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX2P48431 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX2P48431 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX2P48431 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX2P48431 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX2P48431 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX2P48431 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX2P48431 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX2P48431 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX2P48431 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX2P48431 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX2P48431 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX2P48431 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX2P48431 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX2P48431 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX2P48431 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX2P48431 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX2P48431 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX2P48431 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX2P48431 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX2P48431 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX2P48431 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX2P48431 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX2P48431 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms