Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1AP35321 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPRR1AP35321 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms