Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RXRBP28702 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RXRBP28702 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
RXRBP28702 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RXRBP28702 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RXRBP28702 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RXRBP28702 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RXRBP28702 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RXRBP28702 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RXRBP28702 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
RXRBP28702 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RXRBP28702 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RXRBP28702 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RXRBP28702 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RXRBP28702 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RXRBP28702 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RXRBP28702 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RXRBP28702 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RXRBP28702 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
RXRBP28702 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RXRBP28702 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RXRBP28702 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
RXRBP28702 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RXRBP28702 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RXRBP28702 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RXRBP28702 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RXRBP28702 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RXRBP28702 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RXRBP28702 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RXRBP28702 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RXRBP28702 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RXRBP28702 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RXRBP28702 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RXRBP28702 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RXRBP28702 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
RXRBP28702 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
RXRBP28702 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RXRBP28702 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RXRBP28702 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RXRBP28702 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RXRBP28702 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RXRBP28702 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RXRBP28702 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RXRBP28702 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RXRBP28702 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RXRBP28702 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RXRBP28702 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RXRBP28702 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RXRBP28702 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RXRBP28702 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RXRBP28702 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RXRBP28702 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RXRBP28702 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RXRBP28702 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RXRBP28702 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
RXRBP28702 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RXRBP28702 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
RXRBP28702 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RXRBP28702 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RXRBP28702 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RXRBP28702 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RXRBP28702 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
RXRBP28702 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RXRBP28702 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RXRBP28702 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
RXRBP28702 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RXRBP28702 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RXRBP28702 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RXRBP28702 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RXRBP28702 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RXRBP28702 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RXRBP28702 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RXRBP28702 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RXRBP28702 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RXRBP28702 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
RXRBP28702 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RXRBP28702 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
RXRBP28702 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RXRBP28702 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RXRBP28702 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
RXRBP28702 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
RXRBP28702 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RXRBP28702 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
RXRBP28702 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RXRBP28702 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RXRBP28702 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RXRBP28702 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RXRBP28702 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RXRBP28702 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
RXRBP28702 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RXRBP28702 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RXRBP28702 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RXRBP28702 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RXRBP28702 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RXRBP28702 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RXRBP28702 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RXRBP28702 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RXRBP28702 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RXRBP28702 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
RXRBP28702 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms