Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFD1P11586 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTHFD1P11586 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFD1P11586 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms