Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFTPBP07988 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFTPBP07988 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPBP07988 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms