Protein–RNA interactions for Protein: O60784

TOM1, Target of Myb protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1O60784 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOM1O60784 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOM1O60784 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOM1O60784 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOM1O60784 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOM1O60784 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOM1O60784 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOM1O60784 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOM1O60784 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOM1O60784 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOM1O60784 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOM1O60784 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOM1O60784 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOM1O60784 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOM1O60784 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
TOM1O60784 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOM1O60784 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOM1O60784 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOM1O60784 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
TOM1O60784 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOM1O60784 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOM1O60784 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
TOM1O60784 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOM1O60784 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOM1O60784 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
TOM1O60784 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOM1O60784 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOM1O60784 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOM1O60784 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOM1O60784 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOM1O60784 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOM1O60784 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOM1O60784 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TOM1O60784 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOM1O60784 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOM1O60784 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOM1O60784 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOM1O60784 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOM1O60784 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOM1O60784 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOM1O60784 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOM1O60784 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOM1O60784 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TOM1O60784 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOM1O60784 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOM1O60784 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOM1O60784 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOM1O60784 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOM1O60784 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TOM1O60784 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOM1O60784 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOM1O60784 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOM1O60784 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOM1O60784 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOM1O60784 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOM1O60784 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOM1O60784 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOM1O60784 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOM1O60784 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOM1O60784 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TOM1O60784 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOM1O60784 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOM1O60784 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOM1O60784 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOM1O60784 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TOM1O60784 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOM1O60784 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOM1O60784 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TOM1O60784 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOM1O60784 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOM1O60784 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOM1O60784 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOM1O60784 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOM1O60784 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOM1O60784 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
TOM1O60784 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOM1O60784 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOM1O60784 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
TOM1O60784 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOM1O60784 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOM1O60784 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOM1O60784 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOM1O60784 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOM1O60784 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOM1O60784 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOM1O60784 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOM1O60784 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOM1O60784 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOM1O60784 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TOM1O60784 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TOM1O60784 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOM1O60784 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOM1O60784 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOM1O60784 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOM1O60784 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOM1O60784 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOM1O60784 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOM1O60784 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TOM1O60784 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TOM1O60784 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms