Protein–RNA interactions for Protein: O60583

CCNT2, Cyclin-T2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2O60583 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNT2O60583 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNT2O60583 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNT2O60583 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNT2O60583 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNT2O60583 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms