Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KRW8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KRW8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KRW8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KRW8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KRW8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KRW8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KRW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KRW8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KRW8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KRW8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KRW8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KRW8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KRW8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KRW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
J3KRW8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KRW8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KRW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KRW8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KRW8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KRW8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KRW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KRW8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KRW8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KRW8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KRW8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KRW8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KRW8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KRW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KRW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KRW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KRW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3KRW8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3KRW8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3KRW8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3KRW8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3KRW8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3KRW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3KRW8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3KRW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3KRW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3KRW8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3KRW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3KRW8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3KRW8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3KRW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KRW8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KRW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KRW8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KRW8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KRW8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KRW8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KRW8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KRW8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3KRW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KRW8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KRW8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KRW8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3KRW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KRW8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KRW8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KRW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KRW8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3KRW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KRW8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KRW8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KRW8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KRW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KRW8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KRW8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KRW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KRW8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KRW8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KRW8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KRW8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KRW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KRW8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KRW8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KRW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KRW8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KRW8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KRW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KRW8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KRW8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KRW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KRW8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KRW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KRW8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KRW8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KRW8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KRW8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KRW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KRW8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KRW8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KRW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KRW8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KRW8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KRW8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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