Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BMQ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BMQ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BMQ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BMQ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BMQ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BMQ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BMQ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BMQ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BMQ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BMQ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BMQ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BMQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BMQ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BMQ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BMQ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BMQ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BMQ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BMQ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BMQ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BMQ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BMQ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BMQ9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BMQ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BMQ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BMQ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BMQ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BMQ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BMQ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BMQ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BMQ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BMQ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BMQ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BMQ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BMQ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BMQ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BMQ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BMQ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BMQ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BMQ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BMQ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BMQ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BMQ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BMQ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BMQ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BMQ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BMQ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BMQ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BMQ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BMQ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BMQ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BMQ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BMQ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BMQ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BMQ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BMQ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BMQ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BMQ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BMQ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BMQ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BMQ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BMQ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BMQ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BMQ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BMQ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BMQ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BMQ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BMQ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BMQ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BMQ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BMQ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BMQ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BMQ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BMQ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BMQ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BMQ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BMQ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BMQ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BMQ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BMQ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BMQ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BMQ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BMQ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BMQ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BMQ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BMQ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BMQ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BMQ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BMQ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BMQ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BMQ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BMQ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BMQ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BMQ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BMQ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BMQ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BMQ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms