Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A1W2PPC1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1W2PPC1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A1W2PPC1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A1W2PPC1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1W2PPC1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1W2PPC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms