Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms