Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD21O60216 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD21O60216 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD21O60216 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD21O60216 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD21O60216 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD21O60216 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD21O60216 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD21O60216 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms