Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms