Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms