Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3C1V9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3C1V9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3C1V9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3C1V9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3C1V9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3C1V9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3C1V9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3C1V9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q3C1V9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q3C1V9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3C1V9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3C1V9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3C1V9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3C1V9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3C1V9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3C1V9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms