Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARID3CA6NKF2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms