Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms