Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms