Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAD1O00515 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LAD1O00515 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAD1O00515 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAD1O00515 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAD1O00515 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAD1O00515 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms