Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
J3KRW8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3KRW8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
J3KRW8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3KRW8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KRW8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KRW8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3KRW8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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