Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
TNIKQ9UKE5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNIKQ9UKE5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms