Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE4Q8N205 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms